Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms