Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp8nlA2ABX0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms