Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700023F06RikA2AB62 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms