Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms