Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700028J19RikA0A0U1RP08 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms