Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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