Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms