Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms