Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
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