Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cln5Q3UMW8 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Cln5Q3UMW8 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Cln5Q3UMW8 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Cln5Q3UMW8 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Cln5Q3UMW8 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Cln5Q3UMW8 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Cln5Q3UMW8 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cln5Q3UMW8 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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