Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms