Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PtpreP49446 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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PtpreP49446 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PtpreP49446 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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