Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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