Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ggta1P23336 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
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Ggta1P23336 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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Ggta1P23336 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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Ggta1P23336 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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Ggta1P23336 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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Ggta1P23336 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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Ggta1P23336 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ggta1P23336 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ggta1P23336 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ggta1P23336 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ggta1P23336 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ggta1P23336 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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