Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccl20O89093 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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