Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ApobE9Q414 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
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