Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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Ccdc171E9Q1U1 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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Ccdc171E9Q1U1 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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Ccdc171E9Q1U1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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Ccdc171E9Q1U1 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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Ccdc171E9Q1U1 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
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Ccdc171E9Q1U1 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc171E9Q1U1 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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