Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms