Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms