Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Chmp3Q9CQ10 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Chmp3Q9CQ10 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Chmp3Q9CQ10 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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