Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Pggt1bQ8BUY9 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Pggt1bQ8BUY9 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Pggt1bQ8BUY9 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Pggt1bQ8BUY9 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Pggt1bQ8BUY9 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Pggt1bQ8BUY9 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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