Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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Ccdc18Q640L5 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Ccdc18Q640L5 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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Ccdc18Q640L5 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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Ccdc18Q640L5 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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Ccdc18Q640L5 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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Ccdc18Q640L5 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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Ccdc18Q640L5 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
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Ccdc18Q640L5 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Ccdc18Q640L5 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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