Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Hoxd10P28359 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd10P28359 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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