Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd11P23813 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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