Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
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Usp9yF8VPU6 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Usp9yF8VPU6 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Usp9yF8VPU6 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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