Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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