Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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Ccdc171E9Q1U1 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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