Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cldn8Q9Z260 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn8Q9Z260 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms