Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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