Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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