Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rprd1bQ9CSU0 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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