Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Chmp3Q9CQ10 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chmp3Q9CQ10 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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