Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Pggt1bQ8BUY9 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Pggt1bQ8BUY9 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pggt1bQ8BUY9 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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