Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Traf3ip1Q149C2 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms