Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms