Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxd11P23813 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms