Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccl20O89093 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms