Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ApobE9Q414 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ApobE9Q414 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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