Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc171E9Q1U1 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms