Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ddx60E9PZQ1 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ddx60E9PZQ1 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms