Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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Chmp3Q9CQ10 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Chmp3Q9CQ10 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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