Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Cldn16Q925N4 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
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Cldn16Q925N4 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cldn16Q925N4 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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