Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Vipas39Q8BGQ1 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Vipas39Q8BGQ1 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
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Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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Vipas39Q8BGQ1 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Vipas39Q8BGQ1 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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