Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc18Q640L5 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc18Q640L5 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc18Q640L5 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Ccdc18Q640L5 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Ccdc18Q640L5 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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