Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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