Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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