Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Hoxd1Q01822 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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