Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms