Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd10P28359 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Hoxd10P28359 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Hoxd10P28359 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Hoxd10P28359 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd10P28359 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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