Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ggta1P23336 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ggta1P23336 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms